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应用笔记|基于 Opentrons Flex 的自动化 SPR 样品制备

应用笔记|基于 Opentrons Flex 的自动化 SPR 样品制备 配图1

表面等离子共振(SPR)技术广泛应用于药物筛选、抗体表征和靶点验证等场景。在 SPR 实验中,研究人员通常需要配制 5–8 个浓度点的分析物溶液,通过监测不同浓度下的结合响应,拟合获得亲和力(KD)及动力学参数(ka、kd)。浓度梯度的准确性和一致性直接影响实验数据质量,而传统手动配制过程繁琐,随着样品数量增加,操作负担与差错风险也随之上升。

北京大学成都前沿交叉生物技术研究院卞薇洁博士,探索了 Opentrons Flex 全自动移液工作站在 SPR 分析物浓度梯度自动化制备中的应用,并将其与 Biacore 8K 高通量 SPR 系统联用,建立了从样品制备到互作检测的自动化工作流程。通过程序化移液,Flex 可实现母液稀释、浓度梯度配制与样品转板等操作,有效减少重复性人工操作。其移液精度可达 ±0.3% 以内,结合完整的操作日志记录,为实验流程的标准化与可追溯性提供支持。

该工作流程将自动化样品制备与高通量 SPR 检测相结合,有助于提升样品处理效率与操作一致性,减少人工操作带来的差异,让研究人员能够更专注于实验设计与数据分析,为药物研发及生命科学研究中的分子互作分析提供自动化支持。

工作流程

应用笔记|基于 Opentrons Flex 的自动化 SPR 样品制备 配图2

图1|SPR 分析物浓度梯度制备与检测流程

实验方法

工作站配置

本研究使用 Opentrons Flex 液体处理工作站,搭配 Flex 8 通道移液器,以96孔板配制梯度,通过Biacore 8K 进行SPR实验检测。

1. 样品与缓冲液准备

配制 SPR 运行缓冲液,并经 0.22 μm 滤膜过滤。准备分析物母液,记录浓度与溶剂信息,将母液、稀释缓冲液、96 孔样品板及匹配吸头放置于 Flex 工作台的指定位置。

若实验涉及小分子化合物(DMSO溶解),需确保运行缓冲液中DMSO终浓度与样品一致(通常为5%或2%),以消除溶剂效应。

2. Flex 自动化浓度梯度配制

预先在 Opentrons 应用中设置梯度稀释方法。以 6 个浓度点、2 倍梯度稀释为例,设定最高浓度(如 85 nM),后续每个浓度点依次降至前一个浓度的 1/2。系统自动计算各孔所需的母液和稀释缓冲液体积。
使用 Flex 8 通道移液器执行以下操作:
(1)向第 1 列加入计算量的母液;
(2)向第 2–5 列加入计算量的稀释缓冲液;
(3)从第 1 列吸取一定体积的溶液转移至第 2 列,并通过吹打混匀;
(4)依次进行倍比稀释,直至第 6 列。
整个配制过程约仅需 5 分钟,在进行样品批量检测时可显著提升实验效率。

3. Biacore 8K SPR 检测

将装有浓度梯度样品的 96 孔板人工装载至 Biacore 8K。在控制软件中设置动力学或亲和力分析方法,选择已偶联配体的传感器芯片,并设定进样顺序、流速、结合时间与解离时间。启动运行后,系统完成样品进样与响应数据采集。

4. 数据分析

将结果导入 Biacore Insight Evaluation Software,完成参比与空白扣除;涉及 DMSO 时进行相应溶剂校正。选择适用模型进行动力学或亲和力拟合,输出 KD、ka 和 kd 等关键参数。

实验结果

1. 自动化配制样品可获得高质量的动力学数据

以 β2-微球蛋白作为分析物,分别使用人工配制与 Flex 自动化配制的浓度梯度样品,在 Biacore 8K 上完成结合动力学检测。两种方式均获得了随浓度变化的响应曲线,本次实验的动力学拟合参数如下。

配制方式
ka(M⁻¹·s⁻¹)
kd(s⁻¹)
KD(M)
人工配制(图2)
5.22 × 10⁵
2.90 × 10⁻³
5.57 × 10⁻⁹
Flex 配制(图3)
4.92 × 10⁵
3.68 × 10⁻³
7.48 × 10⁻⁹

表1|人工配制与 Flex 自动化配制样品的动力学拟合结果

人工配制与 Flex 配制样品的 KD 均处于纳摩尔水平;结合速率常数(ka)和 解离速率常数(kd)也较为接近,证明Opentrons Flex自动化配制的浓度梯度能够满足SPR动力学分析的要求,且数据重现性良好。

应用笔记|基于 Opentrons Flex 的自动化 SPR 样品制备 配图3

图2|β2-微球蛋白与其抗体的互作分析:人工配制分析物

应用笔记|基于 Opentrons Flex 的自动化 SPR 样品制备 配图4

图3|β2-微球蛋白与其抗体的互作分析:Flex 自动化配制分析物

2. 自动化流程可大幅提升通量,释放人力

与传统手动配制相比,Opentrons Flex自动化流程可缩短批量样品制备时间。自动化操作减少了研究人员持续参与加液、稀释与混匀的需求,使其能够将更多精力投入实验设计与结果分析。

结合Biacore 8K的高通量检测能力(动力学分析64个样品/4小时),该工作流程可实现从样品制备到数据采集的自动化,为大规模药物筛选和抗体筛选提供了可靠的技术支撑。

结论

本研究将 Opentrons Flex 全自动移液工作站与 SPR 样品浓度梯度制备相结合,系统评估了其在分子互作分析样品制备中的应用潜力。借助 Flex 的精准移液与程序化控制,实现了 SPR 分析物浓度梯度的自动化配制,有助于减少繁琐的重复性操作,降低人为操作差异并提升样品处理通量。

在本研究中,Flex 可在短时间完成样品的浓度梯度配制与转移。结合 Biacore 8K 高通量 SPR 系统,进一步构建了覆盖样品制备与分子互作检测的自动化工作流程,为提升 SPR 实验的处理效率与操作一致性提供了新的方案。

笔记作者:卞薇洁,博士,北京大学成都前沿交叉生物技术研究院

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