NGSライブラリビルとは何ですか

NGSライブラリビルディングは、次世代シーケンス（NGSと呼ばれる次世代シーケンステクノロジー）テクノロジープロセスの最初のステップであり、重要なステップでもあります。これには、ハイスループットシーケンサーがシーケンスできるライブラリへの一連の処理ステップを通じて、サンプル内のDNAまたはRNA分子をサンプル内の変換するプロセスが含まれます。この記事では、NGSライブラリの建物について詳しく説明します。

1。NGSライブラリ構造の定義

NGSライブラリビルディングとは、生物学的サンプル（血液、組織など）からDNAまたはRNAを抽出し、一連の生化学的手段を通じてハイスループットシーケンサーに適したライブラリに変換するプロセスを指します。このライブラリには、多数のDNAまたはRNAフラグメントが含まれており、それぞれにシーケンス中の識別と区別のための特定のシーケンスタグがあります。

2。NGSライブラリを構築する手順

NGSライブラリビルディングには通常、次の重要な手順が含まれています。

1。サンプルの準備：まず、DNAまたはRNAを生物学的サンプルから抽出する必要があります。このステップでは、通常、サンプルの収集、処理、精製が含まれ、抽出された核酸の品質と量がその後の実験の要件を満たすようにします。

2。DNA/RNA抽出：適切な抽出方法（化学的方法、物理的方法など）を使用して、サンプルからDNAまたはRNAを分離します。このステップの鍵は、核酸の完全性と純度を確保することです。

3。図書館の構築：

1>断片化：DNAまたはRNAサンプルを短い断片に切ります。これは、化学せん断、酵素切断、または超音波せん断によって達成できます。フラグメントの長さは、通常、図書館の建物の目的とシーケンサーの要件に応じて、100〜1000 bpの間です。

2>修復と結紮：DNAまたはRNAフラグメントの端を修復し、適切なリンカー（短いDNA配列）を追加して、DNAフラグメントをライブラリに結び付けます。このステップは、その後の増幅とシーケンス中にDNAフラグメントが安定して存在できるようにすることです。

3>増幅と精製：ライブラリのDNAフラグメントの数は、PCRおよびその他の方法によって増幅され、不純物と非難されたDNAフラグメントは、ライブラリの品質と純度を改善するために精製手順を通じて除去されます。

4。ライブラリの品質管理：構築されたライブラリの品質管理シーケンス要件を確実に満たすことを確認します。一般的なライブラリの品質制御方法には、ポリアクリルアミドゲル電気泳動、比色測定法、蛍光定量が含まれます。

3。NGSライブラリ構造の適用

NGSライブラリビルディングテクノロジーは、ゲノミクス、トランスクリプトーム、エピゲノミクスの研究で広く使用されています。サンプルにDNAまたはRNAのライブラリを構築し、ハイスループットシーケンスを構築することにより、大量のゲノム、トランスクリプトーム、エピゲノミクスの情報を得ることができ、生命の謎と疾患の発生メカニズムを深く理解することができます。

たとえば、腫瘍関連の研究では、NGSライブラリビルディングテクノロジーは、患者の腫瘍細胞のDNA変異の詳細な状況を迅速かつ正確に理解するのに役立ち、それによって治療と導き薬を支援します。生殖遺伝学の分野では、NGSライブラリビルディングテクノロジーは、非侵襲的出生前診断技術を通じて胎児の遺伝疾患をスクリーニングおよび診断できます。

4。概要

NGSライブラリビルディングは、NGSテクノロジーの重要なステップの1つです。 DNAまたはRNAサンプルをハイスループットシーケンサーに適したライブラリに変換することにより、大規模でハイスループットのゲノムシーケンスとトランスクリプトームシーケンスの可能性を提供します。 NGSテクノロジーの継続的な開発と改善により、NGSライブラリビルディングテクノロジーは、より多くの分野での研究において重要な役割を果たします。