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NGS自動ライブラリ構築におけるNGS(次世代シーケンス)ライブラリ構築のステータスは非常に重要です。これは、シーケンスプロセス全体のコアリンクであり、その後のシーケンスの成功または失敗を直接決定し、データの品質を決定します。
1。基本と前提条件
1.サンプルの準備と処理:NGS自動ライブラリ構造の最初のステップは、通常、サンプルの抽出と精製であり、ライブラリ構造はこれらの加工された高品質のDNAまたはRNAサンプルに基づいています。ライブラリの構造がなければ、元の核酸サンプルをシーケンスに直接使用することはできません。
2。シーケンスプラットフォームの要件:元の核酸サンプルは、フラグメントの長さ、濃度などのシーケンスプラットフォームの要件を直接満たすことができないことがよくあります。ライブラリ構築プロセスは、一連の処理手順を使用して、サンプルをシーケンサーリーディングに適したフォームに変換します。
2。コアリンク
1。断片化処理:ライブラリの構築では、DNAまたはRNAサンプルをシーケンスに適した断片サイズに切断する必要があります。このステップは、その後のシーケンス反応の基礎であり、シーケンスデータのカバレッジと精度を直接決定します。
2。端子修復とライゲーション:断片化されたDNAまたはRNAの端は不均一である可能性があり、シーケンスリンカーの修復とライゲーションが必要です。リンカーは、シーケンサーのシーケンス反応の識別と開始の鍵であるため、このステップの成功または失敗は、シーケンス反応がスムーズに進行できるかどうかを直接決定します。
3。増幅と品質制御:場合によっては、シーケンスのために十分な数のDNAフラグメントを取得するためにPCR増幅が必要になる場合があります。同時に、ライブラリの品質管理は、ライブラリの品質と純度を確保するための重要なステップでもあります。これらの操作はすべてライブラリの建設プロセス中に完了し、その後のシーケンスのための高品質のライブラリを提供します。
iii。シーケンスの結果に影響を与えます
1。データ品質:ライブラリ構造の品質は、シーケンスデータの品質に直接影響します。ライブラリの建設プロセス中に汚染、不完全なリンケージ接続、または増幅バイアスなどの問題がある場合、シーケンスデータの精度と信頼性の低下につながります。
2。シーケンス効率:高品質のライブラリは、シーケンス効率を改善し、シーケンスプロセスのエラーと無駄を減らすことができます。対照的に、質の低いライブラリは、反応のシーケンスの失敗やデータの品質の低下につながり、それにより実験コストと時間が増加する可能性があります。
4。自動ライブラリ構造の利点
1.効率の向上:NGS自動化されたライブラリ構築システムは、複数のステップを統合して、手動の介入と操作時間を短縮し、ライブラリの建設効率を向上させることができます。
2。品質を確保する:自動化された図書館建設システムは、反応条件を正確に制御し、人工誤差を減らすことにより、ライブラリ構造の品質と再現性を改善できます。
3。大規模なシーケンスのサポート:自動化されたライブラリ構築システムは、多数のサンプルを処理し、大規模なシーケンスのニーズを満たし、ゲノミクス、トランスクリプトミクスなどの分野での研究を強力にサポートできます。
NGS(次世代シーケンス)ライブラリ構築は、NGS自動化ライブラリ構築プロセスで重要な役割を果たし、サンプルの準備とハイスループットシーケンスの間の重要なブリッジです。高品質のDNAまたはRNAサンプルが出発材料として必要であるだけでなく、断片化処理、終了修復、リンカー接続、可能な増幅および品質制御の手順などの複雑な分子生物学的操作も含まれます。一緒に、これらの手順により、ライブラリがシーケンスプラットフォームの要件を満たし、その後のシーケンス反応のための強固な基盤を提供できるようになります。
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